El centro arqueológico y la villa de Xpujil se encuentran al centro-sur de la península de Yucatán, en el extremo del estado de Campeche; por tierra, se comunica directamente con Ciudad Escárcega, en Campeche, y con Chetumal, en Quintana Roo.

Por Xpujil pasa la carretera 186, que cruza toda la península y lo convierte en un lugar estratégico y oportuno a mitad del camino, por ejemplo, en la frecuentada ruta Cancún-Palenque. La carretera atraviesa la selva. La belleza de los parajes naturales, así como lo pintoresco de los pequeños poblados que toca, le dan un atractivo especial al recorrido.

Becán está a sólo ocho kilómetros de Xpujil; Chicanná, a once kilómetros. Hay transportes públicos, autobuses y taxis hacia estos sitios arqueológicos, y aún para otros más distantes, como Balamkú, a sesenta y Calakmul a 120 kilómetros.

Xpujil, no cuenta con aeropuerto, pero hay una pista de aterrizaje para algunos vuelos privados, y para algunas empresas que sobrevuelan la región maya en pequeñas avionetas. 

En Xpujil el clima es tropical, cálido húmedo, con una temperatura promedio anual de 27° centígrados. En el verano, hay copiosas precipitaciones, fuertes pero breves, y en invierno, la temperatura desciende hasta los 20° centígrados como promedio.

Tanto en el sitio arqueológico como en la villa y en los tramos carreteros, se experimenta, de forma continua, el fuerte calor tropical y las condiciones de humedad de la selva. 

Su principal atractivo es, también, su principal reto. Xpujil está en el corazón de la selva, por lo que hay que tomar en cuenta todas las condiciones ambientales que implica su visita, desde protector solar hasta repelente de mosquitos.

La ropa cómoda y ligera, así como un calzado deportivo adecuado son indispensables para un recorrido placentero por los sitios arqueológicos, los poblados y las zonas de selva circundantes, en las que se pueden practicar el senderismo y las caminatas.

Para admirar con detalle la riqueza arquitectónica y ornamental de Xpujil y los lugares cercanos como Becán o Chicanná, es necesario recorrer a pie y con detenimiento los sitios arqueológicos, por lo que se sugiere planear una visita de dos o tres días y evitar los trayectos carreteros nocturnos.

En Xpujil hay diferentes alternativas para alojamiento, desde hoteles modestos, limpios y con los servicios básicos, hasta áreas especiales para campismo, ya sea cerca de las villas, las zonas arqueológicas o la selva. 

Se recomienda contratar los servicios de guías turísticos, no solamente para los recorridos en las zonas arqueológicas, sino para información y consulta en materia de hospedaje, transportes, lugares de comida o adquisición de artesanías, principalmente textiles y de grabado en madera.